女性生殖道内微生态环境对妇女健康、生殖功能、婴儿出生等都有重要的作用。微生物导致生殖道环境产生某些生化或炎症反应，生育期健康女性的阴道内有大量正常寄生菌，他们通过自身产生的粘附机制与阴道上皮细胞结合，生长于阴道粘膜表面。其菌群的平衡至关重要，其不仅影响着其中定殖微生物类群，也影响着阴道内环境。而一旦受到某些因素的影响，如体内雌激素含量的变化、致病菌的侵入、长期服用抗生素等，就会使阴道pH值发发生改变，破坏阴道的自然防护，其内部的菌群失衡，就会产生相应的疾病。

　　运用分子生物学结合高通量测序的方法，可以得到生殖道中绝大部分微生物的信息，并通过生信/统计分析，对大量数据进行处理和分析，找到在生殖道中与环境因子（抗生素使用、细菌性炎症等）相关的微生物群落组成，从而进行进一步的研究。