口腔是人体微生物定植生存的重要生态区，口腔微生物不仅有细菌，还包括真菌、病毒、螺旋体及古细菌等。口腔内环境稳态易受外界因素的干扰，口腔内部有多位点、多层次的微生物定植生态区，口腔环境的异质性较肠道更为明显。正常情况下口腔微生物群落之间、微生物与宿主之间密切且复杂的相互作用维持着宿主健康，这种生态平衡被打破将会引发疾病。口腔主要疾病如龋病、牙周病及口腔癌等严重影响人类的生命健康。

　　基于16S rDNA/18S rDNA基因，优化实验方法，增加对痕量微生物的研究，利用高通量测序技术（Roche 454，Illimina MiSeq 2*300、Ion Torrent PGM）来分析口腔微生物的多样性，得到对微生物多样性、群落结构、种系关系精确的解析，增加人们对口腔健康与疾病相关微生物的认识。